基于离散时序基因表达数据的双聚类算法

• 作者: 尚学群 杨蜜静 王淼 许涛
• 来源期刊: 计算机应用研究
• 关键词: 时序基因表达数据 双聚类 共表达 时间点连续 离散化
• 年，卷（期）: 2013,（12）
• 所属期刊栏目: 算法研究探讨
• 页码范围: 3551-3556,3567
• 页数: 7页
• 分类号: TP311|TP301.6
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-3695.2013.12.008

摘要

目前应用于基因表达数据上的双聚类算法大多是基于真实数据提出的,因此易受噪声干扰,且这些算法很少考虑样本间的时序性.提出了一种有效的时间点连续的双聚类挖掘算法DTCB,从离散的时序基因表达数据中挖掘出时间点连续的最大共表达双聚类.该算法使用了一种新的数据离散化方法,同时提出了三种在离.散数据集下基因间的共表达关系;为了提高挖掘效率,DTCB使用了有效的剪枝和输出策略,可以在不产生候选集的情况下一次性挖掘出所有的最大共表达双聚类.通过实验分析,证明DTCB具有高效的性能和良好的鲁棒性,且结果具有较好的统计和生物意义.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	尚学群	西北工业大学计算机学院计算机软件与理论系	23	67	5.0	5.0
2	王淼	西北工业大学计算机学院计算机软件与理论系	24	160	6.0	11.0
3	杨蜜静	西北工业大学计算机学院计算机软件与理论系	2	7	2.0	2.0
4	许涛	西北工业大学计算机学院计算机软件与理论系	5	24	3.0	4.0