从基因表达数据中挖掘最大的行常量双聚类

• 作者: 刘加财 尚学群 王淼 缪苗
• 来源期刊: 计算机应用研究
• 关键词: 双聚类 原始数据 行常量双聚类 范围支持度 基因芯片
• 年，卷（期）: 2011,（12）
• 所属期刊栏目: 算法研究探讨
• 页码范围: 4447-4450
• 分类号: TP393.04
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-3695.2011.12.012

摘要

双聚类方法是当前分析基因表达数据的一个重要研究方向,其挖掘目标是发现哪些基因在哪些实验条件下具有相似的表达水平或者关系密切.目前已提出了许多双聚类算法来挖掘不同类型的双聚类,然而其大部分挖掘效率不高.鉴于此,提出了一个新颖的挖掘算法——MRCluster,其主要是用来从原始的基因表达数据中挖掘最大的行常量双聚类模式.就其挖掘效率来说,它采用的是基于Apriori原则的基因扩展深度优先的挖掘策略,并且在挖掘过程中引入了一些新颖的剪枝技术来提高效率.将MRCluster和一个行常量双聚类模式挖掘方法RAP(range support pattern)算法进行比较,从实验结果上可以看出,相比RAP算法,MRCluster算法对在原始的基因表达数据中挖掘最大的行常量双聚类模式具有更好的效率.因此,MRCluster算法能够有效地从原始的基因表达数据中挖掘最大的行常量双聚类.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	尚学群	西北工业大学计算机学院计算机软件与理论系	23	67	5.0	5.0
2	王淼	西北工业大学计算机学院计算机软件与理论系	24	160	6.0	11.0
3	缪苗	西北工业大学计算机学院计算机软件与理论系	3	11	2.0	3.0
4	刘加财	西北工业大学计算机学院计算机软件与理论系	2	7	2.0	2.0