上海2009甲型H1N1流行性感冒病毒全基因组分析

• 作者: 任广旭 何静 周志统 宋志刚 张小楠 田棣 胡芸文 袁正宏
• 来源期刊: 微生物与感染
• 学科: 医学
• 关键词: 2009甲型H1N1流行性感冒病毒 病毒分离株 核酸测序 进化树分析
• 年，卷（期）: 2010,（4）
• 页码范围: 225-231
• 分类号: R5
• 字数: 3707字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-6184.2010.04.008

摘要

2009年全球暴发2009甲型H1N1流行性感冒(简称流感)疫情,上海于2009年5月出现第1例输入型病例.为了解上海地区输入型2009甲型H1N1流感病毒的生物学特征,以上海较早发现的2例输入型甲型H1N1流感患者作为研究对象,分离出A/Shanghai/37T/2009 和 A/Shanghai/71T/2009病毒,利用实时定量荧光反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)鉴定病毒,通过扫描透射电子显微镜观察、免疫荧光检测、全基因组测序和生物信息软件分析,对这2株流感病毒形态、结构、耐药性、基因特点和病毒型别等进行研究.结果显示,病毒呈现正黏病毒颗粒形态特征;犬肾(MDCK)细胞内的病毒能与患者恢复期血清反应.此2株病毒的全基因核酸序列和氨基酸序列与美国参考株A/California/04/2009(H1N1)有较高同源性,其中第31位氨基酸残基发生改变.对金刚烷胺耐药,而对奥司他韦敏感.基于全基因组的系统发育分析,确认此2株病毒属2009甲型 H1N1流感病毒.