新疆玛纳斯热气泉免培养土壤细菌多样性分析

• 作者: 娄恺 徐建华 曾军 李智 杨红梅
• 来源期刊: 微生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 细菌多样性 16S rDNA 热气泉 地下煤火 限制性片段长度多态性分析(restriction fragment length polymorphism,RFLP)
• 年，卷（期）: 2010,（5）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 568-573
• 分类号: Q939
• 语种: 中文

摘要

[目的]了解新疆玛纳斯热气泉土壤免培养细菌群落组成及多样性.[方法]采用免培养法直接从土壤样品中提取总DNA,利用细菌通用引物对土壤总DNA进行16S rDNA扩增,构建细菌16S rDNA文库.使用Hae Ⅲ限制性内切酶对阳性克隆进行限制性片段长度多态性分析(restriction fragment length polymorphism,RFLP),挑选具有不同酶切图谱的克隆进行测序、比对并构建16S rDNA系统发育树.[结果]从土壤细菌16S rDNA文库中随机挑选了170个阳性克隆,共得到29个不同的分类单元(operational taxonomic unit,OTU).系统发育分析归为6个门:酸杆菌门(Acidobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、厚壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria)和浮霉菌门(Planctomycetes).其中厚壁菌门(Firmicutes)为绝对优势类群,占整个细菌文库的71%.29个OTUs中有14条序列与GenBank中相关序列的相似性低于97%(序列长度约1.5 kb),占序列总数的48%.[结论]热气泉土壤细菌种群多样性较低,但存在大量潜在细菌新种.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	娄恺	新疆农业科学院微生物应用研究所	35	239	9.0	13.0
2	曾军	新疆大学生命科学与技术学院	13	65	6.0	7.0
4	杨红梅	新疆农业科学院微生物应用研究所	9	48	5.0	6.0
5	李智	新疆大学生命科学与技术学院	4	21	3.0	4.0
9	徐建华	新疆大学生命科学与技术学院	4	30	3.0	4.0