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醉马草免培养内生细菌的多样性
醉马草免培养内生细菌的多样性
作者:
史应武
娄恺
张雪兵
曾军
原文服务方:
生态学报
醉马草
内生细菌
免培养法
生物多样性
摘要:
为了解醉马草内生细菌的组成和多样性,采用液氮研磨法提取醉马草总DNA,利用内生细菌16S rRNA基因特异性引物对醉马草总DNA进行16S rRNA基因扩增,构建醉马草内生细菌16S rRNA基因文库.对筛选到249个克隆进行Hae Ⅲ酶切分析,得到57个操作分类单元(OTUs).系统发育分析将其归为4个门:变形杆菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、放线菌门(Actinobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)以及1个未知类群.其中74%的克隆与可培养细菌中的37个属具有高的16SrRNA基因序列相似性(97%-100%),其中芽孢杆菌属(Bacillus spp.)、红球菌属(Rhodococcus spp.)、黄杆菌属(Flavobacteriumspp.)、黄单胞杆菌属(Xanthomonas spp.)最为丰富.另外26%的克隆序列与GenBank中已存细菌16S rRNA基因序列相似性小于96%.研究结果表明,醉马草中可培养内生细菌丰富,多样并且可能存在一些潜在新物种或新类群.
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文献信息
篇名
醉马草免培养内生细菌的多样性
来源期刊
生态学报
学科
关键词
醉马草
内生细菌
免培养法
生物多样性
年,卷(期)
2011,(8)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
2178-2187
页数
分类号
S452
字数
语种
中文
DOI
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
娄恺
新疆农业科学院微生物应用研究所
35
239
9.0
13.0
2
史应武
新疆农业科学院微生物应用研究所
15
111
6.0
10.0
3
曾军
新疆农业科学院微生物应用研究所
13
65
6.0
7.0
4
张雪兵
新疆农业科学院微生物应用研究所
4
67
4.0
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传播情况
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节点文献
醉马草
内生细菌
免培养法
生物多样性
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
生态学报
主办单位:
中国生态学学会
出版周期:
半月刊
ISSN:
1000-0933
CN:
11-2031/Q
开本:
16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1981-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
14991
总下载数(次)
0
总被引数(次)
516896
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生态学报2011年第6期
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