2种栽培环境对铁皮石斛内生细菌多样性的影响

• 作者: 余望寅 刘京晶 周湘 姚冠 扎西拉姆 普琼
• 来源期刊: 浙江农林大学学报
• 关键词: 林木育种学 植物内生细菌 多样性 固氮 菌群分析 石斛多糖
• 年，卷（期）: 2020,（2）
• 页码范围: 284-290
• 页数: 7页
• 分类号: S722.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.11833/j.issn.2095-0756.2020.02.012

摘要

[目的]揭示不同栽培环境对铁皮石斛Dendrobium catenatum内生细菌群落结构的影响,解析与石斛多糖含量存在潜在关联的功能菌种.[方法]针对温室人工基质培养和仿野生立木附生培养2种栽培体系下的铁皮石斛C9品系根、茎、叶等各部组织内生细菌,采用Illumina测序平台的Miseq进行高通量测序分析其菌落结构和多样性,同时利用逐步回归法分析内生细菌分布与组织多糖质量分数的关联性.[结果]铁皮石斛在2种栽培环境不同组织中的菌群结构差异显著(P＜0.05),附生立木仿野生环境比温室环境下物种丰富度更高.同时,根部所含分类操作单元(OTUs)数量最多(112～630个),叶部则最少(28～73个).其中,厚壁菌门Firmicutes (16.7%～34.9%)、拟杆菌门Bacteroidetes(8.7%～35.6%)和变形菌门Proteobacteria(15.9%～42.0%)的OTUs占优势.从菌种生理功能上看,固氮相关的菌种如弗兰克菌科Frankiaceae在树培环境下相对丰度更高,推测可能受树培寡氮环境的影响使固氮菌富集.逐步回归分析结果显示:不动杆菌A cinetobacter在根、茎、叶不同组织中的相对丰度与多糖质量分数变化关联度最大,其次为假单胞菌Pseudomonas.[结论]铁皮石斛内生细菌资源相当丰富,而栽培方式影响菌群分布,且与石斛多糖质量分数具有关联性.