登革4型病毒深圳分离株E基因序列测定及其系统发生分析

• 作者: 何建凡 何雅青 冼慧霞 姚相杰 张海龙 杨洪 阳帆
• 来源期刊: 中国人兽共患病学报
• 学科: 医学
• 关键词: 登革4型病毒 E基因 序列分析 系统发生树
• 年，卷（期）: 2010,（1）
• 所属期刊栏目: 实验研究
• 页码范围: 17-20
• 页数: 4页
• 分类号: R373.3
• 字数: 4140字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2694.2010.01.005

摘要

目的 对深圳市2005年从登革热患者急性期血液中分离到的1株登革病毒进行型别鉴定,从分子水平分析分离株的生物学特征,追踪其可能的地域来源.方法 用C6/36细胞培养增殖病毒株SZ0524,收集病毒液.用逆转录-半套式PCR(RT-semi-nested-PCR)方法和荧光PCR方法对其进行型别鉴定.扩增病毒E基因后进行序列测定,并与不同国家和地区的登革病毒株进行同源性比较和进化树分析.结果 深圳市登革病毒分离株用4型特异性引物扩增出392bp的特异性条带,荧光PCR进一步证实了分离的病毒株为登革4型病毒.SZ0524与登革病毒4型国际标准株H241株在E基因上核苷酸同源性为99.7%,而与登革病毒1、2、3型国际标准株HAWAII、NGC、H87同源性分别为57.0%、59.2%和56.2%.基因进化树显示SZ0524株与D4-73NIID株和D4-61NIID株亲缘关系最近,其次为H241,在进化树的同一分支上,属基因Ⅰ亚型.结论 从分子水平证明从深圳市登革热患者血清中分离到的毒株确为DEN-4型病毒.结合流行病学调查资料,证实此病例为输入性感染病例,该毒株最有可能来源于东南亚一带.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	何建凡	深圳市疾病预防控制中心微生物检验科	60	305	10.0	13.0
2	冼慧霞	深圳市疾病预防控制中心微生物检验科	24	166	6.0	12.0
3	杨洪	深圳市疾病预防控制中心微生物检验科	38	445	11.0	20.0
4	何雅青	深圳市疾病预防控制中心微生物检验科	53	626	13.0	23.0
5	阳帆	深圳市疾病预防控制中心微生物检验科	45	326	10.0	16.0
6	姚相杰	深圳市疾病预防控制中心微生物检验科	29	244	8.0	14.0
7	张海龙	深圳市疾病预防控制中心微生物检验科	42	304	9.0	16.0