我国登革1型病毒广州株基因组全序列测定与分析

• 作者: 于曼 李晓萸 杨佩英 秦鄂德 耿丽卿 胡志君 苑锡同 赵卫 赵月峨
• 来源期刊: 军事医学科学院院刊
• 学科: 医学
• 关键词: 登革热病毒 序列测定 基因组
• 年，卷（期）: 2001,（3）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 161-165
• 页数: 5页
• 分类号: R373.33
• 字数: 3798字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-9960.2001.03.001

摘要

目的:对引起1980年广州登革热流行的登革1型病毒(GZ/80)株的基因组全序列进行测定,为进一步了解病毒基因组结构与功能的关系, 从分子水平探讨登革病毒的传播和流行规律及致病机制提供依据.方法:用广州登革热流行期间从患者血清中分离的GZ/80株病毒感染乳鼠,取鼠脑制备病毒RNA.对基因组编码区分段进行RT-PCR扩增,非编码区采用RACE法进行cDNA扩增.然后将特异产物纯化后与pGEM-T easy载体连接,分别进行克隆测序.结果:GZ/80株基因组全长10?735?nt,5′和3′非编码区长度分别为94?nt和465?nt;基因组单一的读码框架长度为10?176?nt,编码3?392个氨基酸.与登革1型病毒16007株、WestPac74株、新加坡S275/90株和FGA/89株核苷酸序列的同源性分别为94%,93%,95%和91%;推测的氨基酸序列的同源性分别为98.0%,97.9%,97.9%和97.1%.结论:GZ/80株基因组大小及结构与已知的登革1型病毒其他地区分离株一致.系统发生树分析显示,GZ/80株属于第Ⅱ基因型,与台湾87株、88株和泰国80株为同一基因型.提示广州登革热流行的病原可能来自我国.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	秦鄂德	军事医学科学院微生物学流行病学研究所	75	476	11.0	17.0
2	于曼	军事医学科学院微生物学流行病学研究所	43	174	7.0	9.0
3	赵月峨	军事医学科学院微生物学流行病学研究所	6	30	2.0	5.0
4	胡志君	军事医学科学院微生物学流行病学研究所	16	70	6.0	8.0
5	赵卫	军事医学科学院微生物学流行病学研究所	16	106	6.0	10.0
6	杨佩英	军事医学科学院微生物学流行病学研究所	27	182	8.0	12.0
7	苑锡同	军事医学科学院微生物学流行病学研究所	6	28	3.0	5.0
8	李晓萸	军事医学科学院微生物学流行病学研究所	12	100	6.0	9.0
9	耿丽卿	军事医学科学院微生物学流行病学研究所	6	33	4.0	5.0