人博卡病毒广州分离株全基因组序列测定及分析

• 作者: 张莹莹 施静 朱冰 谢嘉慧 邓力 钟家禹 陈翊
• 来源期刊: 国际医药卫生导报
• 关键词: 人博卡病毒 基因组 序列分析 广州
• 年，卷（期）: 2011,（16）
• 所属期刊栏目: 科研课题
• 页码范围: 1933-1936
• 页数: 4页
• 字数: 2221字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.1007-1245.2011.16.002

摘要

目的 探讨广州地区儿童感染的博卡病毒基因组分子结构特点和基因型类型.方法 参考GenBank上的博卡病毒BJ3064株(DQ988933)基因组设计分段扩增引物,进行PCR分段扩增博卡病毒基因组,PCR产物直接送测序公司测序,序列测定,用ClustalW/X和MEGA5.0等软件分析基因组序列.结果 博卡病毒全基因组为5299 bp,提交到GenBank上的序列号为JN128956,将GZ2010-1株全基因组核苷酸序列与GenBank上的博卡病毒HBOV1、HBOV2、HBOV3、HBOV4基因型的全基因组序列进行ClustalW比较,发现与HBOV1基因型同源性最高,为98%～99%,而与HBOV2、HBOV3、HBOV4型的同源性分别为76%、81%、75%.将广州分离GZ2010-1株的VP1基因与Genbank上的HBOV1型株进行比较,结果显示与泰国的2株CU49、CU74的同源性为98%,而与HBOV1型其它株:2株标准株(st1、st2)、JPN-193、BJ3064、WLL-1、GD594等株同源性均为99%,F基因的氨基酸序列同源性为99%～100%.结论 广州地区儿童感染的博卡病毒GZ2010-1株全基因组序列为5299 bp,GenBank序列号为JN128956,GZ2010-1株属于博卡病毒HBOV1型.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	钟家禹	广州市妇女儿童医疗中心病毒室	7	64	3.0	7.0
2	朱冰	广州市妇女儿童医疗中心病毒室	32	317	9.0	16.0
3	邓力	广州市妇女儿童医疗中心呼吸科	36	408	9.0	19.0
4	陈翊	广州市妇女儿童医疗中心病毒室	18	158	7.0	12.0
5	谢嘉慧	广州市妇女儿童医疗中心病毒室	6	66	3.0	6.0
6	张莹莹	广州市妇女儿童医疗中心病毒室	6	65	3.0	6.0
7	施静	广州市妇女儿童医疗中心病毒室	3	9	1.0	3.0