人博卡病毒全基因组序列测定与种系分析

• 作者: 修文琼 刘光华 康玉兰 张文清 沈晓娜 王美爱 谢剑锋 郑奎城
• 来源期刊: 中国人兽共患病学报
• 学科: 医学
• 关键词: 人博卡病毒 全基因组 序列测定 种系分析
• 年，卷（期）: 2010,（2）
• 所属期刊栏目: 实验研究
• 页码范围: 158-162
• 分类号: R373.2
• 字数: 4968字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2694.2010.02.016

摘要

目的 了解福州地区人博卡病毒(HBoV)在儿童呼吸道感染中的检出情况,并对其进行全基因组序列测定和种系分析.方法 收集2007年11月至2008年10月在福建省妇幼保健院因下呼吸道感染住院的重症监护病房的57例小儿鼻咽抽取物标本,用一对特异引物通过PCR扩增法对HBoV基因片段进行检测,对检测出的2例HBoV(FZ1和FZ40)用7对全序列引物进行扩增和拼接,获得这两株病毒全基因组序列,上传GenBank并与基因库中国内外其它10株HBoV的全基因组序列和各氨基酸序列进行比对,并做种系分析.结果 FZ1株基因组序列全长为5 299bp,与HBoV参考株st2株序列长度相同;而FZ40株的基因组序列全长少2bp.病毒全基因组编码4种蛋白,分别是非结构蛋白NS1、核蛋白NP-1和衣壳蛋白VP1、VP2.结论 种系分析显示福州的FZ40株与浙江温岭的WLL-1株关系较近,而FZ1株与北京的两株及泰国的CU6株关系较近.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	沈晓娜		34	122	7.0	8.0
2	郑奎城		27	256	10.0	15.0
3	谢剑锋		36	152	7.0	9.0
4	王美爱		15	62	5.0	6.0
5	刘光华		34	109	5.0	9.0
6	修文琼		13	63	4.0	7.0
7	张文清		6	30	4.0	5.0
8	康玉兰		1	9	1.0	1.0