采用伪氨基酸组成预测水解酶亚家族

• 作者: 张光亚 方柏山 李红春
• 来源期刊: 华侨大学学报（自然科学版）
• 关键词: 水解酶亚家族 特征值 伪氨基酸 k-近邻
• 年，卷（期）: 2010,（3）
• 所属期刊栏目: 学术论文
• 页码范围: 317-321
• 分类号: Q556.03
• 语种: 中文

摘要

利用伪氨基酸组成提取蛋白序列特征值,考察参数λ和w对识别效果的影响,以k-近邻作为基础分类器,用于预测水解酶的亚家族类型.结果表明,伪氨基酸组成特征提取法与单纯的20个氨基酸组成特征方法相比,其识别精度有较大程度提高.20AA组成的平均预测精度为72.3%,而伪氨基酸组成特征提取的识别效果可达82.7%.在参数影响考察方面,自相关性函数个数的选取对识别效果影响较大,而权重因子w对识别效果影响则很小.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	方柏山	华侨大学工业生物技术研究所	137	975	15.0	23.0
2	张光亚	华侨大学工业生物技术研究所	88	491	10.0	20.0
3	李红春	华侨大学工业生物技术研究所	8	14	2.0	2.0