利用16s rDNA方法检测刺参消化道细菌种类

• 作者: 丁丽 丁君 常亚青 李娇 王姮 王美庆
• 来源期刊: 海洋环境科学
• 关键词: 刺参 消化道 16s rDNA Blast比对
• 年，卷（期）: 2010,（2）
• 所属期刊栏目: 技术与方法
• 页码范围: 250-254
• 分类号: Q331
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-6336.2010.02.020

摘要

以2007年7月采自大连瓦房店养殖厂的刺参为实验材料,通过对刺参肠道中的细菌16s rDNA V3区基因进行扩增、克隆测序及序列同源性分析,对其种类进行初步研究.本研究测序获得11条16s rDNA V3区基因序列,并进行Blast同源比对,确定序列同源性,分析出11种细菌,三种梭菌属(Clostridium)细菌,两种为假单胞菌属细菌(Pseudomonas),一种产丙酸菌属细菌(Propionigenium),一种为金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus),有六种细菌分别与4种不可培养的未命名细菌同源,并根据测序结果建立系统发生树.本研究提供了一种检测海洋微生物的方法,为刺参病害诊断提供科学依据,为海洋微生物资源的开发和新种的发现提供了资料.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	常亚青	大连水产学院农业部海洋水产增养殖学重点开放实验室	80	2069	24.0	43.0
2	丁君	大连水产学院农业部海洋水产增养殖学重点开放实验室	34	833	15.0	28.0
3	王姮	大连水产学院农业部海洋水产增养殖学重点开放实验室	2	19	2.0	2.0
4	李娇	大连水产学院农业部海洋水产增养殖学重点开放实验室	1	11	1.0	1.0
5	王美庆	大连水产学院农业部海洋水产增养殖学重点开放实验室	1	11	1.0	1.0