巴西橡胶树棒孢霉落叶病菌Slt2类MAPK同源基因CMP1的克隆与序列分析

• 作者: 张欣 张贺 张辉强 漆艳香 蒲金基 谢艺贤 陆英
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 橡胶树棒孢霉落叶病菌 蛋白激酶 基因克隆 生物信息学
• 年，卷（期）: 2010,（11）
• 页码范围: 1951-1958
• 分类号: S432
• 字数: 4995字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2010.11.015

摘要

根据几种丝状真菌Slt2类MAPK的保守氨基酸序列设计简并引物,从巴两橡胶树棒孢霉落叶病菌[Corynespora cassiicola(Berk.＆ Curt.)Wei]中扩增出MAPK同源基因的部分片段,再利用染色体步移法延伸该片段的上、下游邻接序列,获得MAPK编码基因的全长序列,命名为CMP1(GenBank Accession No.GU321364).序列分析表明,该基因含有5个外显子和4个内含子,编码417个氨基酸的多肽,推测分子量为47.5 ku,等电点为5.57.CMP1含有一个参与双重磷酸化作用的MAPK蛋白激活域(TEY),其氨基酸序列与丝状真菌的MAPK,AAslt2和MAP-kinase等高度同源.系统聚类结果显示,该基因与白菜黑斑病菌(Alternaria brassicicola)、细交链格孢菌(A.alternata)和玉米小斑病菌(Cochliobolus heterostrophus)的Sh2类MAPK基因具有较高的同源性.Southern杂交分析表明,CMP1基因在巴西橡胶树棒孢霉落叶病菌基因组中以单拷贝形式存在.