基于活性和基因从海洋微生物中筛选烯二炔类抗生素

• 作者: 代焕琴 任彪 刘向阳 张立新 裴刚
• 来源期刊: 微生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 烯二炔类抗生素 高通量筛选 重复I型聚酮合成酶
• 年，卷（期）: 2010,（4）
• 所属期刊栏目: 生理和代谢
• 页码范围: 472-477
• 页数: 6页
• 分类号: Q786
• 语种: 中文

摘要

[目的]高质量的海洋微生物菌种库及其天然产物库是新药开发的重要来源.在本研究中我们通过筛选新的烯二炔类抗生素来对已经构建的海洋微生物天然产物库进行质量评价.[方法]首先我们根据烯二炔类抗生素能引起DNA断裂的活性构建了活性筛选模型,并对我们的天然产物库进行筛选;其次根据合成烯二炔核心结构的独特且保守的重复I型聚酮合成酶设计了引物,通过PCR扩增的方法对海洋微生物库进行序列筛选.[结果]通过活性筛选从我们的海洋微生物天然产物库中获得一个阳性的发酵产物.对该阳性菌(LS481)的系统发育学分析表明该菌属于能产生烯二炔类化合物- Dynemicin的Micromonosporachersina,对其发酵产物TLC分析证明该菌确实产生Dynemicin类化合物.通过基因筛选得到了2个具备合成烯二炔核心结构聚酮合成酶的菌株,16S rRNA基因分析显示其中一个很可能为灰色链霉菌(MS098),另外一株菌则同Streptomyces vinaceus NBRC 13425~T和Streptomyces cirratus NRRL B-3250~T最相近.[结论]我们的活性筛选模型能够有效获得烯二炔类物质,结合基因筛选能够进一步获得可能产生烯二炔物质的菌株.初筛结果也再一次验证了我们海洋微生物天然产物库的质量较好.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张立新	中国科学院微生物研究所	70	1572	16.0	38.0
2	裴刚	中国科学院微生物研究所	57	1123	21.0	31.0
6	代焕琴	中国科学院微生物研究所	2	26	2.0	2.0
7	任彪	中国科学院微生物研究所	3	13	2.0	3.0
11	刘向阳	中国科学院微生物研究所	5	75	2.0	5.0