腺苷酸琥珀酸合成酶与其抑制剂的分子机制研究

• 作者: 姚广伟 张潘丹 李向东 杜凤沛 汪月鹏 王明安 路慧哲
• 来源期刊: 高等学校化学学报
• 学科: 化学
• 关键词: 腺苷酸琥珀酸合成酶 抑制剂 分子对接 密度泛函理论
• 年，卷（期）: 2010,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 336-342
• 页数: 7页
• 分类号: O641
• 字数: 4453字
• 语种: 中文

摘要

利用密度泛函B3LYP方法选择6-31G(d)基组对腺苷酸琥珀酸合成酶(AdSS)天然抑制剂及其衍生物的结构进行优化, 并对其稳定性进行了分析, 同时采用Mulliken键序、原子电荷分布、表观静电势等对AdSS抑制剂及其衍生物电子结构与其生物活性相关性进行了理论研究. 基于腺苷酸琥珀酸合成酶(AdSS)与其底物肌苷单磷酸(IMP)复合物的晶体结构以及获得的天然抑制剂衍生物稳定构象, 利用分子对接、分子力学优化及常温分子动力学模拟对AdSS酶与天然抑制剂及其衍生物的相互作用复合物结构进行理论预测. 结果表明, AdSS酶的系列抑制剂中磷酸根基团和乙内酰脲(Hydantoin)官能团构成药效团模型, 识别过程中范德华相互作用能的贡献大于静电相互作用能.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杜凤沛	中国农业大学理学院	35	296	9.0	16.0
2	路慧哲	中国农业大学理学院	16	45	4.0	6.0
3	王明安	中国农业大学理学院	84	689	13.0	25.0
4	李向东	中国农业大学理学院	20	322	8.0	17.0
5	姚广伟	中国农业大学理学院	4	29	3.0	4.0
6	汪月鹏	中国农业大学理学院	1	4	1.0	1.0
7	张潘丹	中国农业大学理学院	1	4	1.0	1.0