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ROC曲线分析在评价计算机虚拟筛选乙酰胆碱酯酶抑制剂中的应用
ROC曲线分析在评价计算机虚拟筛选乙酰胆碱酯酶抑制剂中的应用
作者:
刘述
方兆庚
王真真
罗巧云
葛庆波
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
ROC曲线
乙酰胆碱酯酶
虚拟筛选
打分函数
摘要:
目的:将ROC曲线分析应用在计算机虚拟药物筛选研究领域中.方法:利用分子对接软件以乙酰胆碱酯酶的三维晶体结构为靶,虚拟筛选40个抑制剂和3 960个无活性化合物,利用5种打分函数(Surflex_score,D_score,G_score,PMF_score,ChemScore)对筛选结果打分排序,应用ROC曲线分析打分排序后的结果.结果:ROC曲线分析出利用ChemScore打分函数得出的曲线F的面积(AUC)最大,为0.91;如果特异度作为优先考虑因素时,应用ChemScore打分函数可以获得最多的活性化合物;如果灵敏度作为优先考虑冈素时,应用ChemScore打分函数也可以获得最多的活性化合物.结论:ROC曲线分析同时考虑到了灵敏度和特异度,在计算机虚拟药物筛选过程中,可以根据实际情况设定打分函数的阙值,获得尽可能多的活性化合物.
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篇名
ROC曲线分析在评价计算机虚拟筛选乙酰胆碱酯酶抑制剂中的应用
来源期刊
中国医药导刊
学科
医学
关键词
ROC曲线
乙酰胆碱酯酶
虚拟筛选
打分函数
年,卷(期)
2010,(10)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
1746-1748
页数
分类号
R965.1|R06-39
字数
3808字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1009-0959.2010.10.054
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
葛庆波
5
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2.0
4.0
2
王真真
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207
8.0
10.0
3
罗巧云
8
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4.0
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方兆庚
1
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传播情况
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乙酰胆碱酯酶
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中国医药导刊
主办单位:
国家食品药品监督管理总局信息中心
出版周期:
月刊
ISSN:
1009-0959
CN:
11-4395/R
开本:
大16开
出版地:
北京市西城区宣武门西大街26号院2号楼
邮发代号:
2-492
创刊时间:
1999
语种:
chi
出版文献量(篇)
13409
总下载数(次)
10
总被引数(次)
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