玉米隐花色素基因cry2的电子克隆及生物信息学分析

• 作者: 张桂荣
• 来源期刊: 安徽农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 玉米 cry2 蓝光受体 电子克隆 生物信息学
• 年，卷（期）: 2010,（19）
• 页码范围: 9975-9978
• 分类号: S513
• 字数: 3042字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0517-6611.2010.19.018

摘要

[目的] 获得玉米隐花色素基因cry2的全长cDNA序列,并进行生物信息学分析. [方法] 通过玉米cry2基因的电子克隆和序列分析、不同物种间CRY蛋白同源性比较及进化分析研究了一种新的基因克隆方法.[结果]CRY2蛋白的分子量为78 844.3,理论等电点为5.13,含有20种基本氨基酸,其中含量最高的是Leu和Ser,含量最低的是Cys;含有96个带负电荷的残基,68个带正电荷的残基,其水溶液在280 nm处的消光系数约168 705;其不稳定系数为54.82,脂肪系数为78.01,平均亲水系数为-0.440.预测到CRY2蛋白的二级结构中螺旋占33.4%,β折叠占7.9%,转角占58.6%.玉米CRY2蛋白与高粱、水稻、小麦、拟南芥、油菜、豌豆、烟草等植物的CRY2蛋白及玉米CRY1蛋白具有较高的一致性.玉米CRY1和CRY2蛋白均有699个氨基酸,氨基酸一致率达92.3%. [结论] 电子克隆的结果为玉米cry2序列克隆提供了参考.