玉米高光效基因ppdk的克隆及其生物信息学分析

• 作者: 张宏芝 张跃强 李剑峰 樊哲儒 海热古丽·阿不力孜 王子霞 王重 赵奇
• 来源期刊: 新疆农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 玉米 C4植物 光合作用效率 ppdk 生物信息学
• 年，卷（期）: 2010,（12）
• 页码范围: 2354-2360
• 分类号: S513|S124
• 字数: 4826字
• 语种: 中文

摘要

[目的]获得玉米(Zea mays)的丙酮酸磷酸双激酶基因(以下简称ppdk),并对其进行生物信息学分析.[方法]使用Trizol提取玉米SC704的总RNA,并用特异引物对其进行RT-PCR扩增,将得到的cDNA片段连接到pGEM-T载体后转化大肠杆菌DH5α,然后对阳性克隆进行测序,并对序列进行生物信息学分析.[结果]获得的玉米PPDK基因CDS全长2781bp,与玉米z561ppdk基因同源性为99%;其编码的多肽链包含926个氨基酸,与玉米PPDK同源性为97%.[结论]克隆了玉米C4型丙酮酸磷酸双激酶(PPDK)基因,它所编码的氨基酸序列具备PPDK蛋白的保守序列和催化活性中心区域.该基因的成功克隆为今后利用其改造C3植物的光合效率以提高粮食单产奠定了良好的基础.