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福州野生蕉隐花色素和光敏色素基因家族的克隆及其表达分析
福州野生蕉隐花色素和光敏色素基因家族的克隆及其表达分析
作者:
余运康
冯新
刘炜婳
刘转霞
张梓浩
林玉玲
程春振
赖钟雄
陈裕坤
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
野生蕉
隐花色素
光敏色素
光质处理
表达分析
摘要:
采用RT-PCR结合RACE法从福州野生蕉试管苗中克隆隐花色素和光敏色素基因家族成员的cDNA序列,命名为MuCryl、MuCry2a、MuCry2b、MuPh yB、MuPhyC1.MuCrys和MuPhys的cDNA序列依次为2 330、2 859、2 752、3 272、3 912 bp,编码698、666、669、1 089、1 003个氨基酸.生物信息学分析表明:MuCrys和MuPhys均属不稳定、亲水蛋白,具跨膜结构域和卷曲螺旋结构,都不具信号肽,均定位于细胞核.系统进化树分析结果表明:Cry1和Cry2聚为两大类,其中MuCry1与小果野蕉、海枣和油棕Cry1的亲缘关系最近,与双子叶植物大豆Cry1的亲缘关系最远;MuCry2a和MuCry2b与小果野蕉、水稻和小麦Cry2的亲缘关系最近,与双子叶植物碧桃Cry2的亲缘关系最远;MuPhyB与小果野蕉PhyB的亲缘关系最近,与双子叶植物毛果杨PhyB的亲缘关系最远;MuPhyC1与小果野蕉和马来兰花蕉PhyC的亲缘关系最近,与双子叶甜橙PhyC亲缘关系最远.qRT-PCR结果表明:MuCry的3个成员和MuPhyC1对不同光质响应存在差异,蓝光都可促进MuCry 3个成员mRNA的转录,红光促进MuPhyC1 mRNA的转录,在黑暗、红光、绿光和黄光下MuCry1的表达受到抑制;黄光和红光对MuCry2a的转录水平影响不明显,而黑暗、暖白光和绿光可抑制MuCry2a的表达水平;MuCry2b的转录水平受蓝光和红光的正调控,而受绿光的负调控;MuPhyC1在红光处理下的表达量最高,蓝光和暖白光下的表达量相近,白光、绿光、黄光和黑暗处理下的表达量差异不大,表明MuPhyC1积极响应红光刺激.
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文献信息
篇名
福州野生蕉隐花色素和光敏色素基因家族的克隆及其表达分析
来源期刊
热带作物学报
学科
农学
关键词
野生蕉
隐花色素
光敏色素
光质处理
表达分析
年,卷(期)
2017,(11)
所属期刊栏目
生物技术与组织培养
研究方向
页码范围
2089-2099
页数
11页
分类号
S668.1
字数
7604字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1000-2561.2017.11.016
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隐花色素
光敏色素
光质处理
表达分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
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相关学者/机构
期刊影响力
热带作物学报
主办单位:
中国热带作物学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1000-2561
CN:
46-1019/S
开本:
大16开
出版地:
海南省海口市龙华区学院路4号
邮发代号:
创刊时间:
1980
语种:
chi
出版文献量(篇)
5760
总下载数(次)
12
总被引数(次)
35220
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