雨生红球藻植物类型隐花色素基因克隆与序列分析

• 作者: 崔红利 张宏江 李润植 杭伟 王晓丹 许文鑫 赵春超 马浩天
• 来源期刊: 山西农业科学
• 关键词: 雨生红球藻 隐花色素 基因克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2020,（5）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 677-682
• 页数: 6页
• 分类号: S917.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2481.2020.05.06

摘要

为了从雨生红球藻中获得感知蓝光信号的植物类型隐花色素(CRY)序列,采用同源克隆和RACE相结合的方法获得了雨生红球藻编码植物类型Hae-P-CRY的cDNA全长,并对其序列进行生物信息学分析.结果 表明,Hae-P-CRY基因的cDNA全长为3 608 bp,包含开放阅读框全长2 988 bp,编码995个氨基酸,预测等电点6.19,理论分子质量为107.7 ku.经Blot P分析发现,Hae-P-CRY氨基酸序列与莱菌衣藻来源植物类型CreCRY氨基酸序列的相似性达到66.6％,与拟南芥CRY氨基酸序列相似性为46.94％.系统进化分析表明,Hae-P-CRY与其他真核绿藻来源的植物型CRY聚在一支,属于植物类型CRY.结构域分析表明,Hae-P-CRY基因含有光感知PHR结构域和信号转导CCT结构域,暗示具有感知和转导光信号功能.试验从雨生红球藻得到植物类型Hae-P-CRY基因序列,可为其表达、功能及互作蛋白研究奠定基础,同时为进一步解析雨生红球藻在蓝光响应中的分子机制奠定基础.