雨生红球藻己糖激酶基因的克隆和生物信息学分析

• 作者: 季春丽 宋亚楠 崔红利 张宏江 张春辉 李润植 石颖
• 来源期刊: 激光生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 己糖激酶 cDNA全长 结构域 系统进化 雨生红球藻
• 年，卷（期）: 2020,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 359-367
• 页数: 9页
• 分类号: Q785|Q786
• 字数: 6369字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-7146.2020.04.010

摘要

本研究以雨生红球藻(Haematococcus pluvialis)为研究对象,利用同源克隆和cDNA末端快速扩增技术(RACE)相结合的方法获得了雨生红球藻己糖激酶(HaeHK)基因的cDNA全长序列,并进行了序列分析.结果表明,HaeHK的cDNA全长为2047 bp,其中开放阅读框的长度为1716 bp,编码571个氨基酸.该蛋白预测的等电点(pI)为6.49,理论分子量为60.61 kD.经在线BLAST同源比对分析发现,其与团藻(Volvox carteri)和莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)来源HKs的相似性分别达到50％和46％.通过序列比对和结构域分析可知,HaeHK蛋白存在与高等植物来源HKs相似的结构域,且具有HK家族的显著特征.高级结构同源建模表明其具有典型的"蝴蝶"结构.系统进化分析显示,高等植物和真核绿藻(Chlorophyta)来源HKs可能来自共同的祖先.本文首次从雨生红球藻中获得编码HaeHK的基因序列,为雨生红球藻中HK的表达和功能研究奠定基础,同时为解析雨生红球藻己糖利用及代谢的分子机制提供线索.