冷冻电镜三维重构在CPU-GPU系统中的并行性

• 作者: 张佩珩 李临川 李兴建 谭光明
• 来源期刊: 华中科技大学学报（自然科学版）
• 学科: 工学
• 关键词: 任务级并行 数据级并行 高性能计算 统一计算设备架构(CUDA) 冷冻电镜
• 年，卷（期）: 2011,（z1）
• 所属期刊栏目: GPU技术
• 页码范围: 115-119
• 分类号: TP319
• 语种: 中文

摘要

为了有效地发掘和利用异构系统在应用和体系结构上的并行性,以冷冻电镜三维重构为例展示如何利用应用程序潜在的并行性.通过分析重构计算所有的并行性,实现了将动态自适应的划分算法用于任务在异构系统上高效的分发.在曙光星云系统的部分节点系统(32节点)上评估并行化的程序性能.实验证明:多层次的并行化是CPU与GPU异构系统上开发并行性的有效模式；CPU-GPU混合程序在给定问题规模上相对单纯CPU程序获得2.4倍加速比.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李兴建	中国科学院计算技术研究所计算机系统结构重点实验室	7	18	3.0	4.0
5	谭光明	中国科学院计算技术研究所计算机系统结构重点实验室	16	34	4.0	5.0
6	张佩珩	中国科学院计算技术研究所计算机系统结构重点实验室	12	73	5.0	8.0
7	李临川	中国科学院计算技术研究所计算机系统结构重点实验室	1	1	1.0	1.0