苹果EST数据分析平台的构建及初步应用

• 作者: 刘兰英 岳鹏 李天红 柳爱玲 钟翡 雷恒久
• 来源期刊: 中国农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 苹果 EST 数据分析平台 序列延伸 干旱胁迫
• 年，卷（期）: 2011,（4）
• 页码范围: 134-140
• 分类号: S661.1
• 语种: 中文

摘要

为更有效地利用苹果EST公共数据资源,方便信息交流与共享,本研究构建了苹果EST数据分析平台Malus domestica Micro-Workstation,并整合了专为苹果定制的序列延伸系统。该数据分析平台具有本地信息查询、序列简单注释和短序列延伸等功能。以所建平台为辅助工具,从已公布的324 308条苹果EST序列中预测干旱胁迫相关基因,共有1 979条EST延伸序列可能与干旱胁迫相关,其中预计下调的数量为959,上调的为1 020,共计109条干旱胁迫相关序列可能具有全长编码区;从细胞组分、分子功能和生物过程等3方面将这些延伸序列归类,为进一步克隆苹果干旱胁迫相关基因提供线索。