利用PCR-DGGE方法分析不同鸡群的盲肠微生物菌群结构变化

• 作者: Yongquan Cui 李永洙
• 来源期刊: 生态学报
• 关键词: 蛋鸡 肉鸡 变性梯度凝胶电泳(DGGE) 盲肠菌落
• 年，卷（期）: 2011,（21）
• 页码范围: 6513-6521
• 分类号: S831|Q938
• 语种: 中文

摘要

研究不同品种、饲养阶段的健康和不良鸡群对盲肠细菌种群结构和多样性的影响.使用基于16S rDNA的PCR-DGGE技术,结合割胶回收DNA进行克隆和测序,分别以4、6、10、16、20、40周龄蛋鸡及1、2、4、6、7、8周龄肉鸡健康、不良鸡群盲肠内容物为样本,研究其中特定细菌类群的16S rDNA序列片段指纹图谱,并进行聚类分析,鉴定特异性和共性种群.在两品种健康鸡群盲肠内容物的细菌群落中,Lactobacillus属菌株的相似性均高于不良鸡群,并且在不同饲养阶段的健康、不良鸡群间指纹图谱平均条带数差异显著(P＜0.05)；而Bacteroides属菌株在健康鸡群盲肠内容物细菌的相似性与不良鸡群较为相近,健康、不良鸡群间平均条带数差异显著(P＜0.05)；Clostridium属菌株在蛋鸡20、40周龄的平均条带数差异不显著(P＞0.05),但肉鸡各周龄健康、不良鸡群间的平均条带数差异显著(P＜0.05).序列测序结果,在蛋鸡产蛋期健康、不良鸡群样本中均检测到能动乳杆菌(Lactobacillus agilis),而育雏和育成期中均检测到鸟乳杆菌(Lactobacillus aviaries)和不可培养细菌；两品种的健康、不良鸡群样本中均检测到Bacteroides属的生酸拟杆菌(Bacteroides acidifaciens)、不可培养物细菌(Uncultured bacterium)；而健康、不良蛋鸡群样本中均检测到Clostridium属不可培养的变形菌(Uncultured proteobacterium),健康肉鸡群中检测到索氏志贺菌(Shigella sonnei),而两品种不良鸡群中均缺乏此类菌种.结果显示,不同品种、饲养阶段的鸡群,其盲肠细菌群落的组成差异显著,并且细菌种群结构对鸡群的生长发育影响较大.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李永洙	临沂大学生命科学学院	23	153	8.0	12.0