基因组选择及其应用

• 作者: 包振民 孙效文 李恒德
• 来源期刊: 遗传
• 关键词: 基因组选择 高通量遗传标记 育种值估计
• 年，卷（期）: 2011,（12）
• 所属期刊栏目: 综述
• 页码范围: 1308-1316
• 字数: 8029字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1005.2011.01308

摘要

品种选育在农业生产中占有十分重要的地位,育种值估计是品种选育的核心.随着遗传标记的发展,尤其是高通量的基因分型技术,使得从基因组水平估计育种值成为可能,即基因组选择.文章将基因组选择的方法分为两类:一是基于估计等位基因效应来预测基因组估计育种值(GEBV),如最小二乘法,随机回归-最佳线性无偏预测(RR-BLUP)、Bayes、主成分分析等方法；二是基于遗传关系矩阵来预测GEBV,通过采用高通量标记构建个体间的遗传关系矩阵,然后用线性混合模型来预测育种值,即 GBLUP法,并以这两种分类简要介绍了基因组选择各种方法的大致原理.影响基因组选择准确性的因素主要有标记类型和密度、单倍型长度、参考群体大小和标记-数量性状基因座(QTL)连锁不平衡(LD)大小等；在基因组选择的各种方法中,一般说来Bayes方法和GBLUP方法具有较高的准确性,最小二乘法最差；GBLUP 计算速度快,能够将标记和系谱结合起来,因而比其他方法更具优势.尽管基因组选择取得了很大进展,但在理论方面还面临着一些挑战,如联合育种、长期选择的遗传进展及如何解析与性状有关和无关的标记等.基因组选择在一些动植物育种上已经开始应用,在人类遗传倾向预测和进化动力学研究中也有潜在的应用前景.基因组选择在个体间亲缘关系的量化上有了突破,比传统方法更加精确,因此,基因组选择将会是动植物育种史上革命性的事件.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	包振民	中国海洋大学海洋生命学院	63	1149	20.0	32.0
2	孙效文	中国水产科学研究院生物技术研究中心	159	3935	35.0	57.0
6	李恒德	中国水产科学研究院生物技术研究中心	8	54	3.0	7.0