鲢InDel-RFLP标记开发及其在连锁图谱构建中的应用

• 作者: 危起伟 张立楠 张鹏 杨官品 邹桂伟
• 来源期刊: 淡水渔业
• 学科: 生物学
• 关键词: 鲢(Hypophthalmichthys molitrix) 碱基插入缺失 限制性片段长度多态性 连锁图谱
• 年，卷（期）: 2011,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 43-50,29
• 分类号: Q343.1+3
• 字数: 3748字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-6907.2011.02.007

摘要

基于随机测序的鲢(Hypophthbalmichthys molitrix)基因组片段,尝试开发基于InDel的限制性片段长度多态性标记(InDel-RFLP).结果显示:共133个片段中,65个在一个野生鲢群体(该野生鲢群体采自长江流域荆州段,31个个体)中表现多态性.共检测到163个等位基因,每位点等位基因数从2到4不等,平均2.5个.65个多态性标记中,有35个被添加到鲢SSR-AFLP性别平均连锁图谱上.长约2kb的片段比长约lkb的片段更适用于InDel-RFLP标记开发.设计特异引物,扩增基因组片段,用4种限制性内切酶(BsuR I、Hha I、Taq I和Vsp I)之一切成适宜聚丙烯酰胺凝胶电泳分离的小片段,电泳分离、银染分型.该标记系统避免了对InDel精确定位的困难,通过高分辨PAGE分型,可为鲢连锁图谱构建和性状定位提供丰富的标记位点.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	危起伟	中国水产科学研究院长江水产研究所	43	424	11.0	19.0
2	杨官品	中国海洋大学海洋生物遗传育种教育部重点实验室	77	830	17.0	25.0
3	邹桂伟	中国水产科学研究院长江水产研究所	48	499	11.0	21.0
4	张鹏	中国海洋大学海洋生物遗传育种教育部重点实验室	37	144	7.0	10.0
5	张立楠	中国海洋大学海洋生物遗传育种教育部重点实验室	2	20	2.0	2.0