应用SSR和SRAP标记构建青虾遗传连锁图谱

• 作者: 乔慧 傅洪拓 吴滟 熊贻伟 蒋速飞 龚永生
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 农学
• 关键词: 青虾 日本沼虾 SSR SRAP 遗传连锁图谱
• 年，卷（期）: 2012,（2）
• 页码范围: 202-210
• 分类号: S96
• 字数: 5616字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1118.2012.00202

摘要

采用SSR和SRAP标记结合拟测交策略构建青虾(Macrobrachium nipponense)遗传连锁图谱.共有175个标记(含27个SSR、148个SRAP标记)分布在53个连锁群上.每个连锁群含2～8个标记,其中不少于3个标记的连锁群有35个,连锁对18个,平均每个连锁群的标记数为3.3个；连锁群长度在6.7～91.2 cM之间,相邻标记间最大间隔为49.0 cM,最小为1.4 cM,平均间隔为13.1 cM.青虾框架图谱长度为997.2 cM,图谱观察总长度为2 270.5cM,根据估算,青虾遗传连锁图谱预期长度为4 380.6 cM,图谱的覆盖率为51.83％.本研究构建了青虾遗传连锁图谱,该图谱也是淡水虾蟹类第一张遗传连锁图谱,可为青虾QTL定位、基因克隆、遗传选育等提供指导,并为进一步构建高密度的青虾遗传连锁图谱奠定了基础.