cDNA芯片技术筛选斑马鱼皮肤免疫相关差异表达基因

• 作者: 吕爱军 李槿年 王艺 胡秀彩 薛军
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 农学
• 关键词: 斑马鱼 皮肤 基因表达 基因芯片
• 年，卷（期）: 2011,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 1226-1233
• 分类号: S943
• 字数: 5185字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1118.2011.01226

摘要

研究旨在筛选与鱼类皮肤免疫相关的功能基因,试图解释鱼类皮肤局部免疫应答的分子机制.采用斑马鱼(Danio rerio)基因cDNA芯片(affymetrix),以葡萄球菌(Staphylococcus sp.)感染诱导的成体斑马鱼为实验动物模型,从斑马鱼皮肤组织中提取总RNA,经Biotin荧光标记与拥有15 617个cDNA片段的基因芯片杂交,对斑马鱼皮肤组织中基因表达谱进行初步分析.在斑马鱼皮肤组织中共检测出175个差异表达基因,其中有150个上调表达基因(ratio＞2.0)和25个下调表达基因(ratio＞0.5);在皮肤组织150个上调基因中,91个为已知功能基因,59个为未知功能基因.根据基因文库同源功能基因(GO)分析,将175个差异表达基因分为13个主要的生物功能与代谢通路,其中参与免疫应答相关基因包括鱼主要组织相容性复合体(MHC)I类基因区的基因(UEA,UFA)、补体(Clq,C7-1)、凝集素(HBL3,LGALS1L3)、应急反应生长基因(EGR-1)、肿瘤坏死因子超家族基因(TNFSF10L4)、凝血因子(F5)、转铁蛋白基因(TF-α)和一些蛋白酶等.结果证实,MHC I类分子、补体、凝集素和蛋白酶等参与鱼类皮肤的抗葡萄球菌感染免疫应答,为将来以斑马鱼感染模型研究皮肤局部与细菌的互作机制提供了科学参考；同时表明采用基因芯片方法初探斑马鱼皮肤免疫系统是基本可行的.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吕爱军	徐州师范大学生命科学学院	42	295	11.0	15.0
2	李槿年	安徽农业大学动物科技学院	98	829	15.0	23.0
3	胡秀彩		17	125	7.0	11.0
4	王艺	安徽农业大学动物科技学院	3	14	2.0	3.0
5	薛军	徐州师范大学生命科学学院	2	22	2.0	2.0