草鱼Ⅰ型微卫星标记的发掘及其多态性检测

• 作者: 刘航 廖兰杰 朱作言 李偲 李华英 汪亚平 石米娟 黄容
• 来源期刊: 水生生物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 草鱼 微卫星标记 多态信息含量
• 年，卷（期）: 2011,（4）
• 页码范围: 681-687
• 分类号: Q346+.5
• 字数: 3799字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1035.2011.00681

摘要

表达序列标签(EST)是发掘Ⅰ型微卫星标记的重要资源.研究运用生物信息学方法,从草鱼头肾组织3027条EST序列中搜索到322个微卫星位点,占整个EST数据库的10.6％.其中,二核苷酸重复位点151个(46.9％),三核苷酸重复位点137个(42.5％),四、五、六核苷酸重复位点较少；在二核苷酸重复位点中,AC/GT重复位点最为丰富,占二核苷酸重复位点总数的50.3％,AG/CT重复次之,占二核苷酸重复位点总数的40.4％,AT和GC重复较少.10个微卫星位点的多态性检测结果显示,4个位点在草鱼测试群体中呈多态性,多态性位点的平均多态信息含量(PIC)和平均遗传杂合度(H)分别为0.5236和0.5441,其中,2个多态性位点的PIC值大于0.5,呈现高度多态性特征.Ⅰ型微卫星标记将为草鱼遗传连锁图谱构建和QTL分析提供有效的基因分子标记.