草莓镶脉病毒（SVBV）ORF Ⅵ基因的克隆及蛋白特性分析

• 作者: 倪方锐 李瑞 江彤 蒋磊 贾琳
• 来源期刊: 西南大学学报：自然科学版
• 学科: 农学
• 关键词: 草莓镶脉病毒 ORF Ⅵ基因 克隆 序列分析 二级结构
• 年，卷（期）: 2011,（12）
• 所属期刊栏目: 农业科学
• 页码范围: 1-6
• 分类号: S436.684
• 语种: 中文

摘要

用CTAB法从感染草莓镶脉病毒（strawberry vein banding virus,SVBV）的草莓叶片中提取总DNA,设计特异性引物扩增SVBV ORF Ⅵ基因的全长片段,进行克隆并测序.序列分析表明SVBV ORF Ⅵ基因完整序列全长1 557bp,编码518个氨基酸.将其与SVBV美国分离物以及花椰菜花叶病毒属其他成员的ORF Ⅵ基因相比较,结果表明SVBV中国分离物ORF Ⅵ基因与SVBV美国分离物ORF Ⅵ基因核苷酸序列相似性最高,达84.5%;而与花椰菜花叶病毒属其他成员的ORF Ⅵ基因序列相似性均较低,仅为23.7%～27.9%.构建SVBV及其同属其他成员ORF Ⅵ基因的系统关系树,结果显示SVBV中国分离物与SVBV美国分离物单独形成1个分支,说明来源于草莓的2个SVBV亲缘关系最近,而与其同属其他成员的亲缘关系均较远.生物信息学分析表明SVBVORF Ⅵ基因表达的P6蛋白序列含有多种蛋白激酶磷酸化位点,其二级结构N端是1个α-螺旋富集区.该研究将为进一步研究P6蛋白的功能提供理论依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	江彤	安徽农业大学植物保护学院	62	201	6.0	10.0
2	李瑞	安徽农业大学植物保护学院	9	95	5.0	9.0
3	倪方锐	安徽农业大学植物保护学院	3	4	1.0	2.0
4	贾琳	安徽农业大学植物保护学院	7	27	3.0	5.0
5	蒋磊	安徽农业大学植物保护学院	9	27	4.0	5.0