用分子模拟方法研究大戟科抗HIV病毒蛋白与腺嘌呤的识别及其运动性

• 作者: 刘嵬 唐典勇 张智锦 胡建平 范晶
• 来源期刊: 生物物理学报
• 学科: 生物学
• 关键词: GAP31 腺嘌呤 分子动力学模拟 构象
• 年，卷（期）: 2011,（10）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 875-882
• 页数: 8页
• 分类号: Q615
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1260.2011.00875

摘要

大戟科抗HIV病毒蛋白(GAP31)能有效地抑制HIV-1整合酶的整合功能,是一种潜在的抗AIDS药物.作者对GAP31蛋白与其底物腺嘌呤(adenine,ADE)的复合物进行了5ns的分子动力学模拟,从能量和氢键两个角度详细分析了GAP31与ADE识别中的关键残基.结果表明,ADE主要结合在GAP31的T71～V80、G111～K120、1161～F170及F87所构成的口袋中,模拟结果与实验吻合.最后,分子整体运动性结果说明,分子的构象变化更多地与糖基化相关,与其抑制整合酶的活性关系不大.