北京基因型结核分枝杆菌感染THP-1细胞系表达谱的研究

• 作者: 付玉红 刘毅 姜广路 宋小运 戴广明 李卫民 范伟兴 赵立平 高峰 黄海荣
• 来源期刊: 首都医科大学学报
• 学科: 医学
• 关键词: 结核分枝杆菌 北京基因型 基因芯片 表达谱
• 年，卷（期）: 2011,（3）
• 所属期刊栏目: 传染病及相关慢性疾病研究进展
• 页码范围: 346-351
• 分类号: R52
• 字数: 4484字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-7795.2011.03.007

摘要

目的 通过分析不同结核分枝杆菌感染巨噬细胞后表达谱的改变,探讨结核病(tuberculosis,TB),尤其是北京基因型结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis M.tb)感染的结核病免疫发病机制.方法 具有IS6110 DNA RFLP和Spoligotyping基因分型结果的265株北京基因型结核分枝杆菌(简称M.tb Beijing genotype)鉴定自2000年中国结核病流行病学抽样调查(简称2000年流调),采用平均连锁方法计算北京基因型结核分枝杆菌中心菌.结核分枝杆菌(M.tb H37Rv)、牛分枝杆菌(M.bovis)标准菌株和M.tb Beijing genotype感染THP-1细胞,采用基因芯片分析其表达谱的改变.结果 输入MAS系统,行进一步的分析.结果 依据计算原则,相似系数最大为0.514,其对应菌株为结核分枝杆菌北京基因型中心菌株.分枝杆菌感染THP-1细胞后相应的芯片结果具有可靠性和可分析性.M.tb H37Rv、M.bovis、M.tb Beijing genotype感染THP-1细胞的共同表达293个基因.共同表达基因的GO和pathway分析,发现一些不为人特别关注,但对结核免疫有一定作用的信号通路,例如B细胞受体信号通路.M.tb H37Rv、M.tb Beijing genotype感染THP-1细胞差异表达基因包括:tnf,tnfrsf 9,pim-1,icam-1和cd48.结论 2000年结核病流调以中国人口为整体,采用分层整群随机抽样.因此获得的M.tb Beijing genotype中心菌株具有中国代表性.293个基因可作为筛选用于菌阴结核病诊断的候选靶标.对这些差异表达基因涉及的信号通路,例如:JAK-STAT信号通路和自然杀伤细胞介导的细胞毒性以及TNF的深入分析,将对理解M.tb Beijing genotype免疫毒性特征有益.