白斑综合征病毒(WSSV)3种PCR检测方法的灵敏度比较

• 作者: 孔杰 孟宪红 张庆文 李战军 罗坤 肖广侠
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 农学
• 关键词: PCR检测法 白斑综合征病毒(WSSV) 灵敏度
• 年，卷（期）: 2011,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 667-673
• 分类号: S945
• 字数: 4931字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1118.2011.00667

摘要

为了探讨不同PCR检测方法的灵敏度,分别利用TaqMan实时定量PCR、世界动物卫生组织(OIE)公布的巢式PCR引物(简称OIE)、黄海水产研究所种质资源与工程育种研究室(GB)设计的引物(简称GB)及2种巢式PCR对应的一步法PCR,对具有不同白斑综合征病毒(White Spot Syndrome Virus,WSSV)含量的中国明对虾(Fenneropenaeus chinensis)样品进行检测.结果显示,当使用已知病毒含量的标准品进行检测时,TaqMan实时定量PCR方法可以检测到l0个WSSV拷贝;OIE巢式PCR与GB巢式PCR方法分别可检测到104和103个WSSV拷贝;单独使用OIE巢式PCR的外引物和内引物扩增时,分别可检测到5×104和2.5×104个WSSV拷贝;单独使用GB巢式PCR的外引物和内引物进行一步法PCR扩增时,分别可检测到104和5×103个WSSV拷贝.使用上述PCR方法分别对44份未知WSSV含量的样品进行验证,定量PCR方法检测阳性率为84.09%,OIE巢式PCR与GB巢式PCR方法检测的阳性率分别为18.18%和27.27%;单独使用OIE巢式PCR的外引物和内引物扩增检测的阳性率均为15.91%;单独使用GB巢式PCR的外引物和内引物扩增检测的阳性率分别为18.18%和20.45%.根据以上结果,PCR方法检测WSSV的灵敏度由高到低依次为:定量PCR、巢式PCR、一步法PCR.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孔杰	中国水产科学研究院黄海水产研究所	89	2666	34.0	49.0
2	孟宪红	中国水产科学研究院黄海水产研究所	25	864	16.0	25.0
3	张庆文	中国水产科学研究院黄海水产研究所	15	226	9.0	15.0
4	罗坤	中国水产科学研究院黄海水产研究所	19	179	9.0	13.0
5	肖广侠	中国水产科学研究院黄海水产研究所	2	20	2.0	2.0
9	李战军	中国水产科学研究院黄海水产研究所	1	16	1.0	1.0