中国荷斯坦牛HSF1基因microRNA SNPs与耐热性能的相关性研究

• 作者: 仲跻峰 李建斌 李秋玲 李芳 李荣岭 王长法 贾祥捷 鞠志花 黄金明
• 来源期刊: 中国农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 中国荷斯坦牛 HSF1 耐热性能 microRNA 多态性
• 年，卷（期）: 2011,（3）
• 页码范围: 570-578
• 分类号: S8
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.ssn.0578-1752.2011.03.018

摘要

[目的]分析638头中国荷斯坦牛HSF1基因多态性与耐热性的关系,以期为中国耐热奶牛分子育种提供参考依据.[方法]设计引物扩增HSF1基因,通过DNA测序、PCR-SSCP和PCR-RFLP技术筛查SNPs并分型,利用miRBASE数据库定位microRNA SNPs,利用SHEsis软件进行配对连锁不平衡分析和单倍型构建,利用SAS软件对不同基因型和单倍型组合个体耐热指标包括红细胞钾浓度、产奶量下降率、直肠温度和耐热系数进行相关分析.应用荧光定量RT-PCR技术研究热应激状态下HSF1 mRNA的转录水平.[结果]发现2个microRNA种子序列新SNPs,T909C和G4693T.其中909位碱基距离microRNA种子序列5'端3 bp,4 693位突变直接使microRNA种子序列破坏.909位点CC、CT基因型奶牛耐热性能显著高于TT基因型(P<0.05);4693位点TT基因型奶牛耐热性能显著高于GG基因型(P<0.05).共构建出4种单倍型、发现10种单倍型组合.其中H2H4单倍型组合红细胞钾浓度和直肠温度显著低于H1H3单倍型组合(P<0.05),耐热系数显著高于H1H3组合(P<0.05),H2H4组合个体产奶量下降率显著低于H1H1组合个体(P<0.05),H2H4为耐热单倍型组合.热应激状态下HSF1 mRNA的转录水平在不同组织中存在差异,在心脏中最高,是肌肉中的11.24倍(P<0.05).[结论] HSF1基因microRNA SNPs可作为奶牛抗热应激的候选分子标记应用于育种实践.