白斑综合征病毒江苏分离株变异区和缺失区基因的序列比较

• 作者: 丁正峰 唐建清 王晓丰 薛晖
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 农学
• 关键词: 白斑综合征病毒 变异区 缺失区 序列分析
• 年，卷（期）: 2011,（5）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 1196-1201
• 分类号: S94
• 字数: 3344字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1118.2011.01196

摘要

为了解白斑综合征病毒(White spot syndrome virus,wssv)在养殖克氏原螯虾(Procambarus clarkii)中的感染流行情况和分子流行病学特征,以及探讨不同病毒株间的遗传进化差异,2008年7月至2010年6月在江苏各主要克氏原螯虾养殖产区共采集了83份样品,应用环介导等温扩增技术(LAMP)检测42份样品为病毒感染阳性,阳性率达50.6％.在此基础上考虑地理和时间因素选取了兴化、盱眙等地的6份样品,PCR扩增、克隆了样品中所携带病毒的变异区和缺失区基因并对其进行了测序.分析结果显示,在变异区除兴化毒株为1 829 bp之外,其余各分离株间差异微小,均在1 440 bp左右；而在缺失区各毒株大小均为384 bp,且核苷酸序列完全一致.随后将各分离株序列与GenBank已公布的毒株做进一步的序列比较分析,结果表明在江苏境内流行的兴化毒株与其余毒株间存在明显差异,在遗传上相距较远,并且推测WSSV变异区和缺失区可能是各自独立进化变异的；同时,缺失变小的病毒基因组更易于适应宿主和环境的变化.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	唐建清		158	1051	18.0	27.0
2	薛晖		83	315	12.0	16.0
3	王晓丰		10	92	6.0	9.0
4	丁正峰		17	189	9.0	13.0