白斑综合征病毒广西株缺失区基因的比较分析

• 作者: 叶欣宇 吴祥庆 张益峰 杨先乐 童桂香 韦信贤 黄国秋 黎小正
• 来源期刊: 上海海洋大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 凡纳滨对虾 白斑综合征病毒 ORF23/24基因 序列分析
• 年，卷（期）: 2014,（1）
• 所属期刊栏目: 水产生物技术
• 页码范围: 8-14
• 分类号: S945.4|S917
• 语种: 中文

摘要

为了解广西养殖凡纳滨对虾中白斑综合征病毒(white spot syndrome virus,WSSV)的感染流行情况,并探讨WSSV广西株缺失区ORF23/24基因的遗传进化差异及其与各地WSSV毒株间的遗传进化关系,2010年5月至2013年9月在广西凡纳滨对虾主产区北海、钦州和防城港共采集306份患病虾样品,应用世界动物卫生组织(OIE)推荐的套式聚合酶链式反应(nested-PCR)方法进行WSSV检测;选取第一轮PCR为阳性的53份样品进行缺失区ORF23/24基因的PCR扩增,并将12份阳性PCR产物进行克隆、序列测定与比较分析.结果显示:306份患病虾样品中有82份为WSSV感染阳性,阳性率为26.8％;12株WSSV广西株缺失区ORF23/24基因大小均为2 096 bp,相对于此区域最为完整的WSSV-TW株,广西株均在中间缺失了10 970 bp;12株WSSV广西株的缺失区ORF23/24基因差异小,核苷酸同源性均在99.6％以上,仅存在少数碱基的替换,没有缺失和插入,其中BH-3、QZ-1、FCG-1和FCG-2的核苷酸序列完全一致;基于缺失区构建的系统发育进化树显示,WSSV广西地方株在遗传上相距较近,全部与印度株IN-05-Ⅰ聚在一个大的分支,而与台湾株、中国株及韩国株在遗传上相距较远.研究表明,WSSV感染在广西凡纳滨对虾主要养殖地区存在一定程度的流行;广西WSSV毒株缺失区ORF23/24基因的变异类型为中间大片段缺失,各毒株间无明显的地域和时间差异;WSSV广西株与印度株IN-05-Ⅰ的遗传进化关系最近.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	韦信贤		28	151	7.0	11.0
3	张益峰		43	149	6.0	11.0
4	黎小正		52	274	10.0	13.0
5	吴祥庆		44	201	9.0	11.0
6	杨先乐	上海海洋大学水产与生命学院	69	353	10.0	16.0
7	童桂香		25	116	6.0	9.0
10	黄国秋		17	69	5.0	7.0
11	叶欣宇		9	64	4.0	8.0