团头鲂主要组织相容性复合体Ⅰ类基因全长cDNA的克隆及组织表达分析

• 作者: 刘至治 唐文乔 李思发 杨金权 马晓茜
• 来源期刊: 上海海洋大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 团头鲂 主要组织相容性复合体 cDNA 克隆 组织表达
• 年，卷（期）: 2011,（1）
• 所属期刊栏目: 水产生物技术
• 页码范围: 34-43
• 分类号: S917
• 语种: 中文

摘要

为了解团头鲂MHC Ⅰ类基因的结构,采用cDNA末端快速扩增(Rapid-amplification of cDNA ends,RACE)技术,首次成功克隆了团头鲂"浦江Ⅰ号"F0基础群体及选育F8世代的MHC Ⅰ类基因,共获得3条cDNA全长序列.序列全长为2 040～2 079 bp,含有87～102 bp的5'UTR,1 035～1 044 bp的编码区(包括信号肽,alpha 1、alpha 2和alpha 3三个结构域,跨膜区和胞质区)及911～946 bp的3'-UTR区,分别编码347、344个氨基酸.F8世代序列的核苷酸/氨基酸的同源性很高,为89.0%/93.0%,而与F0世代的同源性较低(75.3%～77.0%和71.1%～71.4%),呈现出明显的分子多态性.分析表明,团头鲂具有经典的MHC Ⅰ类分子的空间结构,与人类HLA-A2的抗原肽结合区的晶体结构相比,二者的差异主要集中在5个(Ⅰ～V)区上.在Neighborjoining(NJ)法构建的分子进化树中,团头鲂与草鱼的亲缘关系最近,与鲑鳟鱼类、爬行类、鸟类、哺乳类及人类的亲缘关系则渐远.RT-PCR组织表达分析表明,团头鲂MHC Ⅰ类基因在所检测的的8个组织中均表达,在鳃、头肾和血液中有较强的转录本,中等强度表达于肝脏和脾脏,在后肾、肠和肌肉中表达较弱.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李思发	上海海洋大学农业部水产种质资源与利用重点开放实验室	58	725	17.0	22.0
2	唐文乔	上海海洋大学水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	65	364	10.0	16.0
3	刘至治	上海海洋大学水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	15	109	6.0	10.0
4	杨金权	上海海洋大学水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	7	103	4.0	7.0
5	马晓茜	上海海洋大学水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室	2	48	2.0	2.0