光间受体视黄类物质结合蛋白基因(IRBP)在棉鼠亚科物种中的序列变异及其系统发育意义

• 作者: 夏珊 张静
• 来源期刊: 四川动物
• 学科: 生物学
• 关键词: 棉鼠亚科 光间受体视黄类物质结合蛋白基因 碱基组成 中性选择 系统发育
• 年，卷（期）: 2011,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 189-194
• 分类号: Q959.837|Q111
• 字数: 4455字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-7083.2011.02.002

摘要

以光间受体视黄类物质结合蛋白基因(IRBP)为研究对象,从GenBank中下载了棉鼠亚科66个种的IRBP序列,分析IRBP的结构及其在棉鼠亚科的进化关系.G+C含量高于A+T,密码子第3位点的G+C含量高达61.2%,并且呈现出较低的核苷酸多样性(3.786%).IRBP在棉鼠亚科没有经历正向达尔文选择.以IRBP构建的系统发育树和以往研究的结果总体上是一致的,但由于本文样本数量的增加,发现Oryzomyini还存在第3个分支,不同于以往研究只划分了2个分支.同时系统发育树的结构表明Ichthyomyini和Sigmodontini很可能不是两个独立的族.另外和前人以细胞色素b基因构建的系统发育树相比较,树的结构总体上也是一致的.这些都表明IRBP在棉鼠亚科中有较好的应用效果,但要更好地解决此亚科存在的系统发育问题,重点在于增加用于分析的物种数量.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张静		3	0	0.0	0.0
2	夏珊	四川教育学院科学教育系	1	0	0.0	0.0