基于细胞色素b基因序列的中国牛亚科家畜系统发育关系

• 作者: 冀德君 常春芳 常洪 李永红 王兰萍 耿荣庆
• 来源期刊: 中国农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 牛亚科家畜 细胞色素b基因 系统发育 分歧时间
• 年，卷（期）: 2011,（19）
• 所属期刊栏目: 畜牧·资源昆虫
• 页码范围: 4081-4087
• 分类号: S823
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2011.19.019

摘要

[目的]探讨中国牛亚科家畜物种间的系统发育关系,为牛亚科家畜的系统演化历史提供分子证据.[方法]采用PCR产物直接双向测序法,获得普通牛、瘤牛、牦牛、大额牛、沼泽型亚洲水牛和河流型亚洲水牛共6个物种的线粒体DNA Cyt b基因全长序列,运用分子进化软件分析物种间的系统发育关系.[结果]6个牛种的Cyt b基因序列长度均为1 140 bp,没有观察到插入/缺失突变,共检测到220个变异位点,包含213个简约信息位点；Cyt b基因序列变异中转换数明显高于颠换数,转换数和颠换数的比值为5.2,突变没有达到饱和状态.由遗传距离可知,普通牛与瘤牛的亲缘关系最近,而它们与大额牛、牦牛、沼泽型亚洲水牛、河流型亚洲水牛的亲缘关系依次逐渐疏远,牛亚科家畜6个物种分布于4个主要的单系群分支,可划归为家牛属、牦牛属、准野牛属和水牛属；牛种间的分歧时间在0.775-6.43 MYA,亚洲水牛与其它牛种间的分歧时间最长,普通牛与瘤牛的分歧时间最短.大额牛和印度野牛的单系性都没有得到显现,大额牛和印度野牛在线粒体DNA水平上不能清晰地相互区分.[结论]中国牛亚科6个牛种划分为4个分支,分别对应于家牛属、牦牛属、准野牛属和水牛属,家牛属与准野牛属、牦牛属、水牛属的亲缘关系逐渐疏远；6个牛种间的进化分歧时间在0.775-6.43 MYA.大额牛与印度野牛的亲缘关系非常近,两者在较早的世代具有共同的母系起源；不支持大额牛是印度野牛的家养型或驯化种的观点,它们有可能都是现已灭绝的某种野生牛的后代.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	常洪	扬州大学动物科学与技术学院	158	1322	21.0	26.0
2	冀德君	扬州大学动物科学与技术学院	93	384	8.0	13.0
3	王兰萍	盐城师范学院生命科学与技术学院	55	198	8.0	8.0
4	李永红	扬州大学动物科学与技术学院	20	130	7.0	10.0
5	耿荣庆	盐城师范学院生命科学与技术学院	59	194	7.0	8.0
6	常春芳	扬州大学动物科学与技术学院	20	130	7.0	10.0