基于线粒体COI基因序列分析家鸭系统发育关系

• 作者: 徐善金 徐昊翔 杜文兴 熊锴 王伟兰 王林云 虞德兵 陆应林
• 来源期刊: 南京农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 鸭 细胞色素氧化酶Ⅰ DNA条形码 线粒体
• 年，卷（期）: 2011,（6）
• 页码范围: 109-114
• 分类号: S813.9|S834
• 字数: 4621字
• 语种: 中文

摘要

根据北京鸭线粒体DNA( mtDNA)序列设计引物,对中国9个地方鸭和1个番鸭品种线粒体细胞色素氧化酶Ⅰ(CO Ⅰ)基因序列进行PCR反应和测序,并从起始密码子开始分析了1 520 bp的序列.结果显示:所有家鸭个体在1 517位点出现1个T碱基缺失,番鸭与家鸭的mtDNA COI基因碱基组成相似；9个鸭品种个体共检出11种单倍型,单倍型的多样度为0.856.聚类分析结果显示,所有家鸭品种间的遗传距离为0.001～0.002,种内平均值为0.001；番鸭与家鸭遗传距离为0.003 ～0.006.基于Kimura-2模型构建的系统发育进化树进行分析,发现所测定的鸭科物种个体大体分为3类:家鸭与栖鸭属的番鸭聚为第1类,应属于鸭亚科；雁属的白额雁、灰雁与天鹅属的黑天鹅聚为第2类,应属于雁亚科；鹊雁与中国骛一起聚为第3类,应属于鹊雁亚科.上述结果表明,基于COⅠ基因条形码,在亚科阶元上,所有鸭科物种分类与以往分类结果是一致的.因此,使用DNA条形码鉴定物种系统发育关系时,需考虑阶元划分标准.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王林云	南京农业大学动物科技学院	129	1197	18.0	30.0
2	杜文兴	南京农业大学动物科技学院	66	605	15.0	22.0
3	虞德兵	南京农业大学动物科技学院	36	358	12.0	17.0
4	陆应林	南京农业大学动物科技学院	16	89	5.0	9.0
5	徐善金	南京农业大学动物科技学院	8	74	5.0	8.0
6	王伟兰	南京农业大学动物科技学院	3	36	3.0	3.0
7	熊锴	南京农业大学动物科技学院	6	25	2.0	5.0
8	徐昊翔	南京农业大学动物科技学院	3	24	3.0	3.0