巴西橡胶树HbRPS6-2基因的克隆与生物信息学分析

• 作者: 华玉伟 涂敏 蔡海滨 黄华孙
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 巴西橡胶树 HbRPS6-2 基因克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2011,（11）
• 所属期刊栏目: 生物技术应用与组织培养
• 页码范围: 2048-2053
• 分类号: S794.1
• 字数: 3426字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2011.11.010

摘要

从巴西橡胶树甲基化过滤文库中筛选到一个与RPS6同源性较高的基因片段,根据该基因片段序列信息,设计特异引物,利用RACE进行特异片段的5 ′和3′扩增,获得长度为1 327 bp的Hb RPS6-2基因克隆.生物信息学分析表明,该基因包含483 bp的开放阅读框,5′非翻译区为357bp,3′非翻译区为475 bp,编码161个氨基酸.在HbRPS6-2氨基酸序列中没有预测到信号肽和跨膜区,二级结构分析表明其属于混合型蛋白.HbRPS6-2在N端前18个氨基酸区域内有一个较强的疏水区,但整条多肽链表现为亲水性.对15个RPS6系统进化分析发现,巴西橡胶树的RPS6-2基因与多杀性巴氏杆菌的RPS6基因亲缘关系最近,而与拟南芥和玉米等亲缘关系相对较远.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄华孙	中国热带农业科学院橡胶研究所	72	505	11.0	19.0
7	涂敏	中国热带农业科学院橡胶研究所	7	31	3.0	5.0
10	蔡海滨	中国热带农业科学院橡胶研究所	12	39	4.0	5.0
13	华玉伟	中国热带农业科学院橡胶研究所	22	68	5.0	7.0