基于16SrRNA技术的长江口微生物分子生物学鉴定与分析

• 作者: 刘榕磊 曹波 杨红 许强华
• 来源期刊: 上海海洋大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 长江口 16S rRNA 微生物 种群鉴定
• 年，卷（期）: 2011,（2）
• 所属期刊栏目: 水产生物技术
• 页码范围: 191-197
• 分类号: S917
• 语种: 中文

摘要

基于2007年12月与2008年6月长江口上海附近海域采集的海水样品,使用27F和1492R两种通用引物对海洋微生物16S rRNA基因片段进行直接扩增,克隆并测序,构建细菌16S rRNA文库,通过NCBI数据库的基因比对,区分微生物种群,并使用Mega 4.0软件利用16S rRNA序列建立微生物的分子发育树.通过直接提取DNA进行扩增的方法,共检测出17个属的53种不同微生物,微生物种群结构随温度变化明显,优势种随温度变化有所不同,在不同季节水温下,微生物优势种优势明显;冬季以不动杆菌属为优势种群,分子发育树休现的遗传差异性较小;夏季微生物种群结构较复杂,其中以希瓦氏菌属及假单胞菌属为优势种群,分子发育树体现的遗传差异性较大;微生物分布存在明显的季节变化.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨红	上海海洋大学海洋科学学院	67	410	12.0	14.0
2	许强华	上海海洋大学海洋科学学院	23	150	6.0	12.0
3	曹波	上海海洋大学海洋科学学院	1	18	1.0	1.0
4	刘榕磊	上海海洋大学海洋科学学院	1	18	1.0	1.0