新疆南部地方品种绵羊MSTN基因功能区的克隆及其蛋白二级结构和抗原表位的预测

• 作者: 任述强 史惠君 尹阔 李树伟 牛玉清 赵春霞 金波
• 来源期刊: 黑龙江畜牧兽医（上半月）
• 学科: 农学
• 关键词: 新疆南部地方品种绵羊 肌生成抑制素 蛋白功能区 蛋白二级结构 B细胞抗原表位
• 年，卷（期）: 2011,（1）
• 所属期刊栏目: 遗传育种与繁殖
• 页码范围: 44-47
• 页数: 4页
• 分类号: S826.2
• 语种: 中文

摘要

为了确定新疆南部地方品种绵羊肌生成抑制素(MSTN)成熟蛋白的功能区及二级结构和B细胞抗原表位,根据GenBank中绵羊肌生成抑制素基因序列及其所编码蛋白质的序列,应用GenBank的Blast功能检索其蛋白的功能区,并设计引物克隆新疆南部地方品种绵羊MSTN功能区基因,进行序列测定.然后运用DNAStar软件和www.expasy.org在线服务器等生物信息学方法分析其蛋白的二级结构,并通过Jameson-Wolf法、Kyte-Doolittle法、Emini法、Karplus-Schulz法、Hopp & Woods法、Welling法分别预测其抗原指数、亲水性、表面可及性、柔韧性和抗原性等参数,并综合分析、预测该蛋白的B细胞抗原表位.结果表明:克隆出的MSTN功能区基因经测序和比对后与GenBank上Blast的结果相符.绵羊MSTN蛋白的B细胞抗原表位的优势区域最有可能的是肽链的301～305,321～323,331～333,343～344,346,354～356,358位肽段和氨基酸处.