猪水泡病病毒结构蛋白基因的克隆及其蛋白二级结构和淋巴细胞表位的预测

• 作者: 刘光清 刘湘涛 尚佑军 白兴文 罗静初 谢庆阁 郑海学
• 来源期刊: 中国兽医科技
• 学科: 农学
• 关键词: 猪水泡病病毒 结构蛋白 淋巴细胞表位 二级结构 反向遗传学 反向疫苗学
• 年，卷（期）: 2005,（11）
• 所属期刊栏目: 微生物学
• 页码范围: 843-850
• 页数: 8页
• 分类号: S852.659|Q518.1
• 字数: 6379字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-4696.2005.11.001

摘要

以免疫信息学和反向疫苗学为理论根据,利用RT-PCR法获得了猪水泡病病毒(SVDV)HK/70株的基因组序列并测序,应用生物信息学相关软件和方法,对SVDV结构蛋白的二级结构的不同方面及其抗原特异性淋巴细胞表位进行了预测,综合评价了SVDV结构蛋白的抗原特异性细胞表位,并计算出一些潜在的抗原位点.结果表明,VP1蛋白含有的细胞优势抗原表位最多,但其他结构蛋白也含有抗原特异性淋巴细胞表位,有的甚至有可能成为优势抗原表位或对优势抗原表位有协同作用.