高灵敏度巢式PCR方法扩增HBV全长基因组

• 作者: 张天英 杨炳春 葛胜祥 袁权 陈仕海 陈清瑞
• 来源期刊: 厦门大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 乙型肝炎病毒 基因组 巢式聚合酶链式反应
• 年，卷（期）: 2011,（5）
• 所属期刊栏目: 研究简报
• 页码范围: 947-950
• 分类号: Q356.3
• 字数: 2539字
• 语种: 中文

摘要

探讨一种用于乙型肝炎病毒(HBV)基因组扩增的灵敏度高、广谱性好的巢式聚合酶链式反应(nested PCR)方法,适用于较低病毒拷贝数标本的HBV DNA扩增.通过设计两套通用巢式引物,实现对各基因型(A,B,C,D,E,G)HBV均具有较高的扩增效率；采用两步法分段扩增HBV基因组,对两段目的产物进行测序拼接获得HBV的全基因序列.应用本方法对4组病毒拷贝量(IU/mL)分别为:＞1.0×104,1.0×103～1.0×104,2.0×102～1.0×103,＜2.0×102的100份血清标本进行全长基冈组扩增,其中75份获得阳性结果,各组阳性率依次为:100％,66.7％,60％,25％,有效扩增灵敏度为2.0×102～1.0×103 IU/mL;而一步法只在病毒拷贝量＞1.0×104 1U/mL的标本组中获得15份阳性结果,总的阳性率仅为15％,说明该方法扩增灵敏度明显高于一步法.因此,本方法为HBV流行病学调查研究HBV基因组序列提供了更高的灵敏度,可在流行病学调查中发挥重要作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	葛胜祥	厦门大学国家传染病诊断试剂与疫苗工程技术研究中心	30	394	10.0	19.0
2	杨炳春	厦门大学国家传染病诊断试剂与疫苗工程技术研究中心	3	6	1.0	2.0
3	袁权	厦门大学国家传染病诊断试剂与疫苗工程技术研究中心	12	51	4.0	6.0
4	张天英	厦门大学国家传染病诊断试剂与疫苗工程技术研究中心	4	11	2.0	3.0
5	陈清瑞	厦门大学国家传染病诊断试剂与疫苗工程技术研究中心	1	5	1.0	1.0
6	陈仕海	厦门大学国家传染病诊断试剂与疫苗工程技术研究中心	1	5	1.0	1.0