枯草芽胞杆菌Bs-916的全基因组分析

• 作者: 于俊杰 刘永锋 刘邮洲 尹小乐 王晓宇 罗楚平 聂亚锋 陈志谊
• 来源期刊: 中国农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 枯草芽孢杆菌 比较基因组学 共线性 GC偏好
• 年，卷（期）: 2011,（23）
• 所属期刊栏目: 植物保护
• 页码范围: 4807-4814
• 分类号: S476.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2011.23.006

摘要

[目的]对枯草芽胞杆菌Bs-916进行全基因组测序,为今后更好挖掘和利用该菌生防潜力提供较多的分子生物学信息.[方法]通过应用比较基因组学软件与另一测序菌株Bs168进行全基因组序列分析.[结果]Bs-916菌株全基因组大小为3 925 958 bp,GC含量为46.4％,与其它已测序全基因组芽孢杆菌相比,其GC含量最高；预测所得CDS数为4 056个,152个串联重复区域,转座子103个,IS(插入序列)序列数量37个, tRNA 46个,rRNA 39个；比较基因组学分析其含有8个NRPS/PKS基因簇,其中bacillomycin L,macrolactin,difficidin这3个基因簇在比较菌株Bs168中不存在；该菌还含有植酸酶基因、comAPQX及sfp等与生防因子相关的基因.[结论]Bs-916菌株全基因组合有多种抗菌物质编码基因簇,是一类具有极大生防潜力的典型根际革兰氏阳性菌株.该菌株全基因组序列的测定及其遗传操作方法的可行性,有利于其次生代谢产物的开发和利用.次生代谢产物具有潜在的应用价值,有望在未来开发成独特的农业生物工程制剂.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘永锋	江苏农业科学院植物保护研究所	4	36	4.0	4.0
2	聂亚锋	江苏农业科学院植物保护研究所	4	15	3.0	3.0
3	刘邮洲	江苏农业科学院植物保护研究所	4	36	4.0	4.0
4	罗楚平	江苏农业科学院植物保护研究所	4	16	3.0	4.0
5	陈志谊	江苏农业科学院植物保护研究所	7	40	4.0	6.0
6	王晓宇	江苏农业科学院植物保护研究所	4	15	3.0	3.0
7	于俊杰	江苏农业科学院植物保护研究所	1	7	1.0	1.0
8	尹小乐	江苏农业科学院植物保护研究所	1	7	1.0	1.0