枯草芽孢杆菌菌株CGMCC 12426的全基因组测序与分析

• 作者: 侯沁莲 常静林 李轩豪 董辉 贺欣 龙伟
• 来源期刊: 中国医学科学院学报
• 关键词: 枯草芽孢杆菌 基因组测序 高效聚γ谷氨酸
• 年，卷（期）: 2019,（3）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 307-314
• 页数: 8页
• 分类号: Q939.37
• 语种: 中文
• DOI: 10.3881/j.issn.1000-503X.10370

摘要

目的 描述枯草芽孢杆菌CGMCC 12426的微生物特征,对其进行全基因组测序和注释.方法 枯草芽孢杆菌菌株CGMCC 12426基因组DNA测序由太平洋生物技术公司的RSⅡ测序仪基于单分子实时测序(SMRT)技术平台完成,其注释是在NCBI原核基因组注释管道(pGAP)完成.结果 已发布的枯草芽孢杆菌CGMCC 12426的完整基因组序列是由1个环形的4138265 bp的染色体与1个74165 bp的质粒组成,最终预测得到的4581个基因包括4222个编码序列、87个tRNA和30个rRNA(5S rRNA、16S rRNA和23S rRNA)序列.结论 为进一步阐明该菌株的遗传背景提供了基础,也为研究代谢和调控机制提供了重要机会.