结核分枝杆菌全基因组测序数据分析方法与应用进展

• 作者: 李相辰 柳正卫 陆烨玮 朱业蕾 张明五 蒋锦琴 彭小军 王炜欣 高俊顺 王晓萌
• 来源期刊: 中国防痨杂志
• 学科: 经济
• 关键词: 分枝杆菌，结核 全基因组测序 生物信息学
• 年，卷（期）: 2023,（11）
• 所属期刊栏目: 综述
• 页码范围: 1193-1198
• 页数: 5页
• 分类号: R378.91+1,R318.04
• 语种: 中文
• DOI: 10.19982/j.issn.1000-6621.20220219

摘要

全基因组测序技术已经广泛应用于结核分枝杆菌的研究中，包括谱系鉴定、微进化、耐药预测、传播监测、混合感染诊断等多方面。生物信息学在基因组学研究中贯穿了从数据处理、分析到可视化的各个阶段，对全基因组测序技术的应用起到了至关重要的作用。笔者主要介绍和归纳了目前在结核分枝杆菌全基因组测序中常用的主流生物信息学分析软件和平台，并对近年来新开发的生物信息学分析方法从可用性、软件选择及应用等方面进行概述，为同领域研究者更方便、更灵活地开展数据分析和快速选择研究分析工具提供参考。