加工番茄CAPS遗传标记反应体系的优化

• 作者: 余庆辉 帕提古丽 张贵仁 杨涛 杨生保 王柏柯
• 来源期刊: 新疆农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 番茄 CAPS 体系优化
• 年，卷（期）: 2011,（9）
• 页码范围: 1611-1616
• 分类号: S641.2|S188
• 字数: 3045字
• 语种: 中文
• DOI: 65-1097/S.20110928.1656.032

摘要

[目的]以加工番茄M82、IL7 1-5为材料,研究加工番茄CAPS分析中PCR反应体系的主要成分对CAPS扩增结果的影响.[方法]以公开发表并检验稳定的CAPS标记c2_at5g20180为引物,PCR反应采用25 μL反应体积,含模板DNA 100 ng,2.5 UTaq DNA聚合酶,1.5 mmol/L MgCl2,0.2 mmool/L dNTPs,0.15μmmol/L引物.在保持其它因素一致的条件下,通过5个梯度,变化单一因子,筛选最优参数.反应程序为:94℃预变性3 min；94℃变性40 s,55℃退火40 s,72℃延伸90 s,共37个循环,最后72℃延伸10 min,4℃保存产物.[结果]通过体系优化,成功扩增出清晰稳定的PCR产物.[结论]在总体积为25 μL的PCR反应中,含50 ng模板DNA,0.75 UTaq DNA聚合酶,Mg2+终浓度为1.5 mmol/L,dNTP浓度为0.16 mmol/L,引物浓度为0.2 μmol/L时效果最好.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨涛	新疆农业科学院园艺作物研究所	85	384	12.0	16.0
2	王柏柯	新疆农业科学院园艺作物研究所	34	114	7.0	9.0
3	张贵仁	新疆农业科学院园艺作物研究所	7	10	2.0	2.0
4	余庆辉	新疆农业科学院园艺作物研究所	29	134	7.0	11.0
5	帕提古丽	新疆农业科学院园艺作物研究所	28	122	6.0	10.0
6	杨生保	新疆农业科学院园艺作物研究所	29	112	7.0	10.0