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基于GenMAPP的气道变应性疾病基因芯片实验差异基因的功能路径分析
基于GenMAPP的气道变应性疾病基因芯片实验差异基因的功能路径分析
作者:
梁爱华
薛金梅
赵长青
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
鼻炎,变应性
气道变应性疾病
寡核苷酸芯片
生物信息学
趋化因子
摘要:
目的:利用生物信息学方法对变应性鼻炎并发哮喘机制进行初步探讨.方法:利用GenMAPP软件对季节性变应性鼻炎(SAR)与SAR并发哮喘患者鼻黏膜组织Affymetrix寡核苷酸芯片表达谱结果进行分析.首先筛查差异表达基因,然后对差异基因做数据库检索,并对其生物路径进行分析.结果:在38500多个基因中(47000个转录本中),SAR并发哮喘者,其鼻黏膜发生4倍以上差异表达的基因共有689个,其中有233个基因表达上调,456个基因表达下调.MAPPfindder分析示这些差异表达基因参与了69条生物路径.其中细胞因子与细胞因子受体间作用路径中差异表达基因最多,且在此路径中趋化因子CXCL12及其受体CXCR4在变应性鼻炎并发哮喘患者中较单纯变应性鼻炎患者表达均发生显著上调.结论:变应性鼻炎及其并发哮喘过程中许多生物路径参与此过程,其中CXCL12/CXCR4相互作用构成的反应轴在气道变应性疾病中发挥着重要作用.
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文献信息
篇名
基于GenMAPP的气道变应性疾病基因芯片实验差异基因的功能路径分析
来源期刊
临床耳鼻咽喉头颈外科杂志
学科
医学
关键词
鼻炎,变应性
气道变应性疾病
寡核苷酸芯片
生物信息学
趋化因子
年,卷(期)
2011,(8)
所属期刊栏目
实验研究
研究方向
页码范围
371-373
页数
分类号
R765.21
字数
3166字
语种
中文
DOI
10.3969/j.issn.1001-1781.2011.08.012
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
赵长青
山西医科大学第二医院耳鼻咽喉头颈外科
112
492
12.0
15.0
2
薛金梅
山西医科大学第二医院耳鼻咽喉头颈外科
21
62
4.0
7.0
3
梁爱华
山西大学化学生物学与分子工程教育部重点实验室
97
555
13.0
18.0
传播情况
被引次数趋势
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引文网络
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引证文献(0)
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引证文献(0)
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研究主题发展历程
节点文献
鼻炎,变应性
气道变应性疾病
寡核苷酸芯片
生物信息学
趋化因子
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
临床耳鼻咽喉头颈外科杂志
主办单位:
华中科技大学同济医学院附属协和医院
出版周期:
半月刊
ISSN:
1001-1781
CN:
42-1764/R
开本:
大16开
出版地:
武汉解放大道1277号
邮发代号:
创刊时间:
1987
语种:
chi
出版文献量(篇)
10926
总下载数(次)
33
总被引数(次)
62476
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
期刊文献
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